Das Geräusch hatte ich auch schon mal bei meinem A2 und es war tatsächlich der Bremskraftverstärker.
Es wurden zwei verschiedene BKV (MK20/MK60) im A2 verbaut, Du musst bloss schauen ob Deiner mit Steckanschluss ist oder ohne.
http://www.ebay.de/itm/ATE-Bremskraftverstarker-Audi-A2-8Z0-/311427321839?fits=Make%3AAudi|Model%3AA2&hash=item488283cfef:g:nHYAAOSwMmBV0tcD
http://www.ebay.de/itm/Bremskraftverstarker-Original-ATE-03-7850-0102-4-/361290872623?fits=Make%3AAudi|Model%3AA2&hash=item541e9d372f:g:n6UAAOSw2s1UwI5G
Die BKV gibts bei Daparto wesentlich günstiger,die beiden Angebote habe ich nur eingefügt damit Du den Unterschied sehen kannst.